线粒体基因组测序
来源: 本站原创 作者:佚名 发布时间:2015/3/30 16:08:03
线粒体是真核细胞进行氧化磷酸化的场所,主要功能是提供细胞所需要的能量,线粒体拥有自身的DNA和遗传体系,mtDNA的突变会导致一些疾病的产生,同时与生物进化及细胞起源有很密切关系,目前mtDNA 已被广泛用于系统发育重建、谱系生物地理学、群体结构及动态和基因组水平分子进化等领域的研究。
一、技术路线
二、生物信息分析
1、标准服务:
提供一份线粒体基因组全长序列文件(对测序数据进行组装、去除冗余序列、序列调零)。
2、升级服务:
基因组基本分析:基因组大小、基因注释、密码子使用统计等
tRNA ,rRNA 二级结构预测;
系统发育树重构;
序列上传;
其他个性化分析
三、结果示例
线粒体基因组结构图 rRNA二级结构预测
系统发育树构建
四、样品要求
1、样品采集:鉴于线粒体在不同组织中的含量差异大,建议采样时尽量采集线粒体含量相对较高的组织,比如肌肉组织等。
2、样品DNA:提供浓度≥50ng/ul,总量≥5ug,并确保电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。组织样品>1.5g
3、样品保存期间切勿反复冻融。
4、送样务必标清样品编号,管口用Parafilm膜密封。